Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNB1Q02641 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNB1Q02641 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms