Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ID3Q02535 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ID3Q02535 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ID3Q02535 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ID3Q02535 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ID3Q02535 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ID3Q02535 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ID3Q02535 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms