Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN2Q02246 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN2Q02246 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms