Protein–RNA interactions for Protein: Q02203

YKR005C, Uncharacterized protein YKR005C, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR005CQ02203 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
YKR005CQ02203 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.88□□□□□ -2.55
YKR005CQ02203 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.88□□□□□ -2.55
YKR005CQ02203 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.89□□□□□ -2.55
YKR005CQ02203 snR39BsnR39B 96 nt-0.89□□□□□ -2.55
YKR005CQ02203 YNR077CYNR077C 255 nt-0.9□□□□□ -2.55
YKR005CQ02203 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-0.91□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-0.92□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 snR67snR67 82 nt-0.93□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 YDR413CYDR413C 576 nt-0.94□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.94□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 SKI7YOR076C 2244 nt-0.95□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.96□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 RPL39YJL189W 156 nt-0.96□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.96□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 YER181CYER181C 324 nt-0.97□□□□□ -2.56
YKR005CQ02203 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-0.98□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-0.98□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.98□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 YBR178WYBR178W 375 nt-0.99□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 YKL118WYKL118W 312 nt-1□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 snR55snR55 98 nt-1.02□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.03□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-1.03□□□□□ -2.57
YKR005CQ02203 VAR1Q0140 1197 nt-1.04□□□□□ -2.58
YKR005CQ02203 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.07□□□□□ -2.58
YKR005CQ02203 YNL205CYNL205C 423 nt-1.07□□□□□ -2.58
YKR005CQ02203 GIM4YEL003W 336 nt-1.08□□□□□ -2.58
YKR005CQ02203 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.11□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 YPR012WYPR012W 255 nt-1.11□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 YOR302WYOR302W 78 nt-1.12□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-1.13□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 snR48snR48 113 nt-1.13□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 snR77snR77 88 nt-1.14□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.15□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-1.15□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.15□□□□□ -2.59
YKR005CQ02203 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.16□□□□□ -2.6
YKR005CQ02203 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.16□□□□□ -2.6
YKR005CQ02203 YOR102WYOR102W 351 nt-1.16□□□□□ -2.6
YKR005CQ02203 snR52snR52 92 nt-1.19□□□□□ -2.6
YKR005CQ02203 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-1.2□□□□□ -2.6
YKR005CQ02203 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.21□□□□□ -2.6
YKR005CQ02203 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.23□□□□□ -2.61
YKR005CQ02203 snR65snR65 100 nt-1.24□□□□□ -2.61
YKR005CQ02203 snR81snR81 201 nt-1.24□□□□□ -2.61
YKR005CQ02203 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-1.24□□□□□ -2.61
YKR005CQ02203 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.25□□□□□ -2.61
YKR005CQ02203 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.26□□□□□ -2.61
YKR005CQ02203 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.34□□□□□ -2.62
YKR005CQ02203 snR80snR80 171 nt-1.35□□□□□ -2.63
YKR005CQ02203 Q0144Q0144 330 nt-1.35□□□□□ -2.63
YKR005CQ02203 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-1.4□□□□□ -2.63
YKR005CQ02203 YJL150WYJL150W 303 nt-1.4□□□□□ -2.63
YKR005CQ02203 YNL198CYNL198C 303 nt-1.4□□□□□ -2.63
YKR005CQ02203 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.41□□□□□ -2.64
YKR005CQ02203 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.43□□□□□ -2.64
YKR005CQ02203 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-1.43□□□□□ -2.64
YKR005CQ02203 YOR309CYOR309C 381 nt-1.45□□□□□ -2.64
YKR005CQ02203 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.46□□□□□ -2.64
YKR005CQ02203 YBL053WYBL053W 375 nt-1.46□□□□□ -2.64
YKR005CQ02203 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-1.48□□□□□ -2.65
YKR005CQ02203 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.5□□□□□ -2.65
YKR005CQ02203 snR56snR56 88 nt-1.51□□□□□ -2.65
YKR005CQ02203 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.52□□□□□ -2.65
YKR005CQ02203 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.55□□□□□ -2.66
YKR005CQ02203 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.56□□□□□ -2.66
YKR005CQ02203 RPL41AYDL184C 78 nt-1.56□□□□□ -2.66
YKR005CQ02203 snR38snR38 95 nt-1.61□□□□□ -2.67
YKR005CQ02203 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.63□□□□□ -2.67
YKR005CQ02203 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-1.64□□□□□ -2.67
YKR005CQ02203 YGR151CYGR151C 336 nt-1.65□□□□□ -2.67
YKR005CQ02203 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.65□□□□□ -2.67
YKR005CQ02203 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.66□□□□□ -2.68
YKR005CQ02203 snR6snR6 112 nt-1.7□□□□□ -2.68
YKR005CQ02203 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.71□□□□□ -2.68
YKR005CQ02203 snR47snR47 99 nt-1.75□□□□□ -2.69
YKR005CQ02203 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.78□□□□□ -2.69
YKR005CQ02203 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.81□□□□□ -2.7
YKR005CQ02203 snR73snR73 106 nt-1.82□□□□□ -2.7
YKR005CQ02203 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.82□□□□□ -2.7
YKR005CQ02203 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.82□□□□□ -2.7
YKR005CQ02203 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.85□□□□□ -2.71
YKR005CQ02203 SPG3YDR504C 384 nt-1.85□□□□□ -2.71
YKR005CQ02203 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.85□□□□□ -2.71
YKR005CQ02203 YDR543CYDR543C 300 nt-1.87□□□□□ -2.71
YKR005CQ02203 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.93□□□□□ -2.72
YKR005CQ02203 YKL225WYKL225W 348 nt-1.94□□□□□ -2.72
YKR005CQ02203 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.96□□□□□ -2.72
YKR005CQ02203 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.96□□□□□ -2.72
YKR005CQ02203 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.99□□□□□ -2.73
YKR005CQ02203 YNL337WYNL337W 255 nt-2□□□□□ -2.73
YKR005CQ02203 snR85snR85 171 nt-2.01□□□□□ -2.73
YKR005CQ02203 YNL338WYNL338W 159 nt-2.03□□□□□ -2.73
YKR005CQ02203 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-2.04□□□□□ -2.74
YKR005CQ02203 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.07□□□□□ -2.74
YKR005CQ02203 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.13□□□□□ -2.75
YKR005CQ02203 Q0142Q0142 177 nt-2.15□□□□□ -2.75
YKR005CQ02203 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.18□□□□□ -2.76
YKR005CQ02203 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.18□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms