Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms