Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDKL1Q00532 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKL1Q00532 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms