Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms