Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD1P98174 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD1P98174 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD1P98174 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD1P98174 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD1P98174 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD1P98174 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms