Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3AP98173 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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