Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2BP78356 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2BP78356 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms