Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM193AP78312 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms