Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2BP67870 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms