Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPD3P62318 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPD3P62318 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD3P62318 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD3P62318 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD3P62318 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD3P62318 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNRPD3P62318 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNRPD3P62318 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms