Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPS29P62273 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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