Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERV-K104P61576 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERV-K104P61576 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms