Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK11-1P61568 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK11-1P61568 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms