Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LOXL3P58215 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms