Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms