Protein–RNA interactions for Protein: P53237

LST7, Protein LST7, yeastyeast

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LST7P53237 snR52snR52 92 nt-0.21□□□□□ -2.44
LST7P53237 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.23□□□□□ -2.45
LST7P53237 YGR164WYGR164W 336 nt-0.24□□□□□ -2.45
LST7P53237 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.24□□□□□ -2.45
LST7P53237 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.24□□□□□ -2.45
LST7P53237 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.25□□□□□ -2.45
LST7P53237 snR39BsnR39B 96 nt-0.26□□□□□ -2.45
LST7P53237 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.27□□□□□ -2.45
LST7P53237 SBH2YER019C-A 267 nt-0.29□□□□□ -2.46
LST7P53237 snR48snR48 113 nt-0.3□□□□□ -2.46
LST7P53237 snR69snR69 101 nt-0.31□□□□□ -2.46
LST7P53237 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.32□□□□□ -2.46
LST7P53237 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.34□□□□□ -2.46
LST7P53237 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.36□□□□□ -2.47
LST7P53237 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.38□□□□□ -2.47
LST7P53237 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.39□□□□□ -2.47
LST7P53237 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.39□□□□□ -2.47
LST7P53237 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.4□□□□□ -2.47
LST7P53237 RDS3YPR094W 324 nt-0.41□□□□□ -2.48
LST7P53237 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.42□□□□□ -2.48
LST7P53237 YOR102WYOR102W 351 nt-0.43□□□□□ -2.48
LST7P53237 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.44□□□□□ -2.48
LST7P53237 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.44□□□□□ -2.48
LST7P53237 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.45□□□□□ -2.48
LST7P53237 YNL205CYNL205C 423 nt-0.46□□□□□ -2.48
LST7P53237 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.47□□□□□ -2.48
LST7P53237 SEC10YLR166C 2616 nt-0.49□□□□□ -2.49
LST7P53237 YJL150WYJL150W 303 nt-0.49□□□□□ -2.49
LST7P53237 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.51□□□□□ -2.49
LST7P53237 SPG3YDR504C 384 nt-0.51□□□□□ -2.49
LST7P53237 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.52□□□□□ -2.49
LST7P53237 YNL266WYNL266W 420 nt-0.52□□□□□ -2.49
LST7P53237 snR50snR50 90 nt-0.52□□□□□ -2.49
LST7P53237 JLP2YMR132C 627 nt-0.53□□□□□ -2.49
LST7P53237 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.53□□□□□ -2.49
LST7P53237 YNL198CYNL198C 303 nt-0.55□□□□□ -2.5
LST7P53237 YBR178WYBR178W 375 nt-0.56□□□□□ -2.5
LST7P53237 URB1YKL014C 5295 nt-0.59□□□□□ -2.5
LST7P53237 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.59□□□□□ -2.5
LST7P53237 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.59□□□□□ -2.5
LST7P53237 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.64□□□□□ -2.51
LST7P53237 YBL053WYBL053W 375 nt-0.64□□□□□ -2.51
LST7P53237 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.66□□□□□ -2.51
LST7P53237 snR67snR67 82 nt-0.68□□□□□ -2.52
LST7P53237 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.7□□□□□ -2.52
LST7P53237 snR33snR33 183 nt-0.72□□□□□ -2.52
LST7P53237 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.74□□□□□ -2.53
LST7P53237 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.75□□□□□ -2.53
LST7P53237 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
LST7P53237 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
LST7P53237 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
LST7P53237 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.79□□□□□ -2.54
LST7P53237 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.8□□□□□ -2.54
LST7P53237 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.8□□□□□ -2.54
LST7P53237 SKI7YOR076C 2244 nt-0.82□□□□□ -2.54
LST7P53237 YGR151CYGR151C 336 nt-0.82□□□□□ -2.54
LST7P53237 snR161snR161 161 nt-0.87□□□□□ -2.55
LST7P53237 YNL338WYNL338W 159 nt-0.93□□□□□ -2.56
LST7P53237 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.94□□□□□ -2.56
LST7P53237 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.99□□□□□ -2.57
LST7P53237 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1□□□□□ -2.57
LST7P53237 YNL337WYNL337W 255 nt-1□□□□□ -2.57
LST7P53237 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.03□□□□□ -2.57
LST7P53237 Q0032Q0032 291 nt-1.1□□□□□ -2.59
LST7P53237 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.1□□□□□ -2.59
LST7P53237 snR77snR77 88 nt-1.16□□□□□ -2.6
LST7P53237 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.17□□□□□ -2.6
LST7P53237 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.17□□□□□ -2.6
LST7P53237 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.17□□□□□ -2.6
LST7P53237 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.18□□□□□ -2.6
LST7P53237 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.22□□□□□ -2.6
LST7P53237 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.22□□□□□ -2.6
LST7P53237 RPL41AYDL184C 78 nt-1.26□□□□□ -2.61
LST7P53237 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.26□□□□□ -2.61
LST7P53237 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.26□□□□□ -2.61
LST7P53237 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.27□□□□□ -2.61
LST7P53237 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.29□□□□□ -2.62
LST7P53237 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.32□□□□□ -2.62
LST7P53237 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.32□□□□□ -2.62
LST7P53237 snR81snR81 201 nt-1.35□□□□□ -2.63
LST7P53237 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.35□□□□□ -2.63
LST7P53237 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.36□□□□□ -2.63
LST7P53237 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.38□□□□□ -2.63
LST7P53237 snR38snR38 95 nt-1.4□□□□□ -2.63
LST7P53237 snR47snR47 99 nt-1.4□□□□□ -2.63
LST7P53237 YNR077CYNR077C 255 nt-1.44□□□□□ -2.64
LST7P53237 YLR294CYLR294C 330 nt-1.45□□□□□ -2.64
LST7P53237 YOR225WYOR225W 330 nt-1.46□□□□□ -2.64
LST7P53237 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.57□□□□□ -2.66
LST7P53237 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.58□□□□□ -2.66
LST7P53237 snR61snR61 90 nt-1.59□□□□□ -2.66
LST7P53237 YOR309CYOR309C 381 nt-1.59□□□□□ -2.66
LST7P53237 YNL170WYNL170W 396 nt-1.62□□□□□ -2.67
LST7P53237 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.64□□□□□ -2.67
LST7P53237 YKL225WYKL225W 348 nt-1.68□□□□□ -2.68
LST7P53237 snR6snR6 112 nt-1.72□□□□□ -2.68
LST7P53237 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.79□□□□□ -2.7
LST7P53237 ATP8Q0080 147 nt-1.8□□□□□ -2.7
LST7P53237 snR62snR62 100 nt-1.81□□□□□ -2.7
LST7P53237 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.83□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 99.8 ms