Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 YBR178WYBR178W 375 nt0.72□□□□□ -2.29
RTA1P53047 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.71□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
RTA1P53047 snR61snR61 90 nt0.69□□□□□ -2.3
RTA1P53047 SBH1YER087C-B 249 nt0.69□□□□□ -2.3
RTA1P53047 snR69snR69 101 nt0.68□□□□□ -2.3
RTA1P53047 EST1YLR233C 2100 nt0.67□□□□□ -2.3
RTA1P53047 MLP2YIL149C 5040 nt0.67□□□□□ -2.3
RTA1P53047 ORC3YLL004W 1851 nt0.67□□□□□ -2.3
RTA1P53047 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.66□□□□□ -2.3
RTA1P53047 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.66□□□□□ -2.3
RTA1P53047 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.65□□□□□ -2.31
RTA1P53047 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.65□□□□□ -2.31
RTA1P53047 RDS3YPR094W 324 nt0.64□□□□□ -2.31
RTA1P53047 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
RTA1P53047 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.6□□□□□ -2.31
RTA1P53047 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
RTA1P53047 YMR160WYMR160W 2451 nt0.59□□□□□ -2.31
RTA1P53047 TFB5YDR079C-A 219 nt0.59□□□□□ -2.31
RTA1P53047 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.59□□□□□ -2.31
RTA1P53047 UTP20YBL004W 7482 nt0.58□□□□□ -2.32
RTA1P53047 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.56□□□□□ -2.32
RTA1P53047 YMR326CYMR326C 309 nt0.55□□□□□ -2.32
RTA1P53047 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.53□□□□□ -2.32
RTA1P53047 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.53□□□□□ -2.32
RTA1P53047 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.52□□□□□ -2.33
RTA1P53047 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.52□□□□□ -2.33
RTA1P53047 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.49□□□□□ -2.33
RTA1P53047 FMP27YLR454W 7887 nt0.44□□□□□ -2.34
RTA1P53047 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.43□□□□□ -2.34
RTA1P53047 AI1Q0050 2505 nt0.41□□□□□ -2.34
RTA1P53047 snR81snR81 201 nt0.41□□□□□ -2.34
RTA1P53047 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.41□□□□□ -2.34
RTA1P53047 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.4□□□□□ -2.35
RTA1P53047 YHR217CYHR217C 462 nt0.4□□□□□ -2.35
RTA1P53047 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.38□□□□□ -2.35
RTA1P53047 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.36□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.35□□□□□ -2.35
RTA1P53047 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.34□□□□□ -2.36
RTA1P53047 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.33□□□□□ -2.36
RTA1P53047 YBL109WYBL109W 336 nt0.33□□□□□ -2.36
RTA1P53047 snR50snR50 90 nt0.29□□□□□ -2.36
RTA1P53047 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.28□□□□□ -2.36
RTA1P53047 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.26□□□□□ -2.37
RTA1P53047 ESP1YGR098C 4893 nt0.25□□□□□ -2.37
RTA1P53047 SOV1YMR066W 2697 nt0.25□□□□□ -2.37
RTA1P53047 MYO1YHR023W 5787 nt0.25□□□□□ -2.37
RTA1P53047 snR128snR128 126 nt0.24□□□□□ -2.37
RTA1P53047 snR67snR67 82 nt0.22□□□□□ -2.37
RTA1P53047 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.19□□□□□ -2.38
RTA1P53047 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.19□□□□□ -2.38
RTA1P53047 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.18□□□□□ -2.38
RTA1P53047 YOL014WYOL014W 375 nt0.18□□□□□ -2.38
RTA1P53047 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.16□□□□□ -2.38
RTA1P53047 snR62snR62 100 nt0.15□□□□□ -2.39
RTA1P53047 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.14□□□□□ -2.39
RTA1P53047 snR47snR47 99 nt0.13□□□□□ -2.39
RTA1P53047 RPL41AYDL184C 78 nt0.07□□□□□ -2.4
RTA1P53047 THO2YNL139C 4794 nt0.04□□□□□ -2.4
RTA1P53047 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.04□□□□□ -2.4
RTA1P53047 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.03□□□□□ -2.4
RTA1P53047 YER078W-AYER078W-A 165 nt0□□□□□ -2.41
RTA1P53047 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.02□□□□□ -2.41
RTA1P53047 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTA1P53047 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTA1P53047 snR45snR45 172 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTA1P53047 SBH2YER019C-A 267 nt-0.13□□□□□ -2.43
RTA1P53047 SKI7YOR076C 2244 nt-0.15□□□□□ -2.43
RTA1P53047 YKL225WYKL225W 348 nt-0.18□□□□□ -2.44
RTA1P53047 snR38snR38 95 nt-0.21□□□□□ -2.44
RTA1P53047 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.22□□□□□ -2.44
RTA1P53047 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.31□□□□□ -2.46
RTA1P53047 snR64snR64 101 nt-0.32□□□□□ -2.46
RTA1P53047 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.5□□□□□ -2.49
RTA1P53047 snR161snR161 161 nt-0.5□□□□□ -2.49
RTA1P53047 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTA1P53047 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.51□□□□□ -2.49
RTA1P53047 snR53snR53 91 nt-0.53□□□□□ -2.49
RTA1P53047 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.54□□□□□ -2.5
RTA1P53047 URB1YKL014C 5295 nt-0.57□□□□□ -2.5
RTA1P53047 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.63□□□□□ -2.51
RTA1P53047 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.66□□□□□ -2.52
RTA1P53047 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.6 ms