Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDST1P52848 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NDST1P52848 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NDST1P52848 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NDST1P52848 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NDST1P52848 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NDST1P52848 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDST1P52848 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDST1P52848 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms