Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIP4K2AP48426 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms