Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
RANGAP1P46060 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RANGAP1P46060 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms