Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCAMP43121 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCAMP43121 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MCAMP43121 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCAMP43121 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCAMP43121 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCAMP43121 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms