Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CAP42336 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms