Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PBX2P40425 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PBX2P40425 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PBX2P40425 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PBX2P40425 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PBX2P40425 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PBX2P40425 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PBX2P40425 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBX2P40425 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PBX2P40425 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBX2P40425 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBX2P40425 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms