Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGAEP38570 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms