Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GJC1P36383 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GJC1P36383 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms