Protein–RNA interactions for Protein: P35197

GCS1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein GCS1, yeastyeast

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCS1P35197 BUD3YCL014W 4911 nt1.01□□□□□ -2.25
GCS1P35197 SCC2YDR180W 4482 nt1.01□□□□□ -2.25
GCS1P35197 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.01□□□□□ -2.25
GCS1P35197 BEM3YPL115C 3387 nt1.01□□□□□ -2.25
GCS1P35197 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
GCS1P35197 SEC10YLR166C 2616 nt1□□□□□ -2.25
GCS1P35197 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.98□□□□□ -2.25
GCS1P35197 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
GCS1P35197 RPM2YML091C 3609 nt0.97□□□□□ -2.25
GCS1P35197 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.97□□□□□ -2.25
GCS1P35197 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
GCS1P35197 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
GCS1P35197 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
GCS1P35197 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
GCS1P35197 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
GCS1P35197 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.96□□□□□ -2.26
GCS1P35197 YSP1YHR155W 3687 nt0.96□□□□□ -2.26
GCS1P35197 GLG1YKR058W 1851 nt0.95□□□□□ -2.26
GCS1P35197 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.94□□□□□ -2.26
GCS1P35197 ULP2YIL031W 3105 nt0.92□□□□□ -2.26
GCS1P35197 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.92□□□□□ -2.26
GCS1P35197 ORC3YLL004W 1851 nt0.91□□□□□ -2.26
GCS1P35197 YOL014WYOL014W 375 nt0.91□□□□□ -2.26
GCS1P35197 EST1YLR233C 2100 nt0.91□□□□□ -2.26
GCS1P35197 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.9□□□□□ -2.27
GCS1P35197 snR47snR47 99 nt0.9□□□□□ -2.27
GCS1P35197 snR69snR69 101 nt0.89□□□□□ -2.27
GCS1P35197 CSE1YGL238W 2883 nt0.88□□□□□ -2.27
GCS1P35197 RKR1YMR247C 4689 nt0.88□□□□□ -2.27
GCS1P35197 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.87□□□□□ -2.27
GCS1P35197 LTE1YAL024C 4308 nt0.85□□□□□ -2.27
GCS1P35197 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.84□□□□□ -2.27
GCS1P35197 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.84□□□□□ -2.27
GCS1P35197 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.84□□□□□ -2.27
GCS1P35197 NIP1YMR309C 2439 nt0.83□□□□□ -2.28
GCS1P35197 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.82□□□□□ -2.28
GCS1P35197 YMR160WYMR160W 2451 nt0.82□□□□□ -2.28
GCS1P35197 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.8□□□□□ -2.28
GCS1P35197 RDS3YPR094W 324 nt0.8□□□□□ -2.28
GCS1P35197 BUL2YML111W 2763 nt0.79□□□□□ -2.28
GCS1P35197 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.79□□□□□ -2.28
GCS1P35197 UTP20YBL004W 7482 nt0.78□□□□□ -2.28
GCS1P35197 snR64snR64 101 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.77□□□□□ -2.29
GCS1P35197 snR53snR53 91 nt0.76□□□□□ -2.29
GCS1P35197 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.74□□□□□ -2.29
GCS1P35197 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.74□□□□□ -2.29
GCS1P35197 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.73□□□□□ -2.29
GCS1P35197 YKL225WYKL225W 348 nt0.72□□□□□ -2.29
GCS1P35197 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.71□□□□□ -2.3
GCS1P35197 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.71□□□□□ -2.3
GCS1P35197 snR38snR38 95 nt0.7□□□□□ -2.3
GCS1P35197 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.68□□□□□ -2.3
GCS1P35197 RPL41AYDL184C 78 nt0.67□□□□□ -2.3
GCS1P35197 snR50snR50 90 nt0.67□□□□□ -2.3
GCS1P35197 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.65□□□□□ -2.31
GCS1P35197 AI1Q0050 2505 nt0.64□□□□□ -2.31
GCS1P35197 PET111YMR257C 2403 nt0.64□□□□□ -2.31
GCS1P35197 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.63□□□□□ -2.31
GCS1P35197 MLP1YKR095W 5628 nt0.61□□□□□ -2.31
GCS1P35197 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.31
GCS1P35197 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.59□□□□□ -2.31
GCS1P35197 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.59□□□□□ -2.31
GCS1P35197 FMP27YLR454W 7887 nt0.58□□□□□ -2.32
GCS1P35197 IQG1YPL242C 4488 nt0.58□□□□□ -2.32
GCS1P35197 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.57□□□□□ -2.32
GCS1P35197 SKI7YOR076C 2244 nt0.53□□□□□ -2.33
GCS1P35197 snR67snR67 82 nt0.52□□□□□ -2.33
GCS1P35197 MLP2YIL149C 5040 nt0.51□□□□□ -2.33
GCS1P35197 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.49□□□□□ -2.33
GCS1P35197 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.48□□□□□ -2.33
GCS1P35197 THO2YNL139C 4794 nt0.4□□□□□ -2.35
GCS1P35197 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.4□□□□□ -2.35
GCS1P35197 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.4□□□□□ -2.35
GCS1P35197 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.37□□□□□ -2.35
GCS1P35197 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.37□□□□□ -2.35
GCS1P35197 SOV1YMR066W 2697 nt0.37□□□□□ -2.35
GCS1P35197 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.33□□□□□ -2.36
GCS1P35197 ESP1YGR098C 4893 nt0.33□□□□□ -2.36
GCS1P35197 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.27□□□□□ -2.37
GCS1P35197 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.24□□□□□ -2.37
GCS1P35197 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.24□□□□□ -2.37
GCS1P35197 snR75snR75 89 nt0.22□□□□□ -2.37
GCS1P35197 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.21□□□□□ -2.38
GCS1P35197 snR128snR128 126 nt0.21□□□□□ -2.38
GCS1P35197 PAU9YBL108C-A 129 nt0.17□□□□□ -2.38
GCS1P35197 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.14□□□□□ -2.39
GCS1P35197 snR77snR77 88 nt0.09□□□□□ -2.4
GCS1P35197 SBH2YER019C-A 267 nt0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39 ms