Protein–RNA interactions for Protein: P32566

SMI1, Cell wall assembly regulator SMI1, yeastyeast

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMI1P32566 snR65snR65 100 nt-0.61□□□□□ -2.51
SMI1P32566 snR33snR33 183 nt-0.61□□□□□ -2.51
SMI1P32566 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.62□□□□□ -2.51
SMI1P32566 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.63□□□□□ -2.51
SMI1P32566 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
SMI1P32566 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
SMI1P32566 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
SMI1P32566 YOR170WYOR170W 306 nt-0.63□□□□□ -2.51
SMI1P32566 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.65□□□□□ -2.51
SMI1P32566 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.66□□□□□ -2.52
SMI1P32566 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.67□□□□□ -2.52
SMI1P32566 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.68□□□□□ -2.52
SMI1P32566 snR69snR69 101 nt-0.7□□□□□ -2.52
SMI1P32566 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.7□□□□□ -2.52
SMI1P32566 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.72□□□□□ -2.52
SMI1P32566 YOR302WYOR302W 78 nt-0.72□□□□□ -2.52
SMI1P32566 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.73□□□□□ -2.53
SMI1P32566 snR39BsnR39B 96 nt-0.77□□□□□ -2.53
SMI1P32566 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.79□□□□□ -2.54
SMI1P32566 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.79□□□□□ -2.54
SMI1P32566 snR161snR161 161 nt-0.79□□□□□ -2.54
SMI1P32566 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.8□□□□□ -2.54
SMI1P32566 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.81□□□□□ -2.54
SMI1P32566 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.82□□□□□ -2.54
SMI1P32566 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.82□□□□□ -2.54
SMI1P32566 RDS3YPR094W 324 nt-0.82□□□□□ -2.54
SMI1P32566 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
SMI1P32566 YNL266WYNL266W 420 nt-0.86□□□□□ -2.55
SMI1P32566 snR50snR50 90 nt-0.87□□□□□ -2.55
SMI1P32566 snR48snR48 113 nt-0.89□□□□□ -2.55
SMI1P32566 JLP2YMR132C 627 nt-0.93□□□□□ -2.56
SMI1P32566 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.95□□□□□ -2.56
SMI1P32566 snR80snR80 171 nt-0.96□□□□□ -2.56
SMI1P32566 snR52snR52 92 nt-0.96□□□□□ -2.56
SMI1P32566 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.98□□□□□ -2.57
SMI1P32566 YNL205CYNL205C 423 nt-0.98□□□□□ -2.57
SMI1P32566 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.98□□□□□ -2.57
SMI1P32566 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.99□□□□□ -2.57
SMI1P32566 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.02□□□□□ -2.57
SMI1P32566 SKI7YOR076C 2244 nt-1.05□□□□□ -2.58
SMI1P32566 YBR178WYBR178W 375 nt-1.05□□□□□ -2.58
SMI1P32566 snR67snR67 82 nt-1.06□□□□□ -2.58
SMI1P32566 YOR102WYOR102W 351 nt-1.08□□□□□ -2.58
SMI1P32566 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.09□□□□□ -2.58
SMI1P32566 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.12□□□□□ -2.59
SMI1P32566 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.17□□□□□ -2.6
SMI1P32566 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.21□□□□□ -2.6
SMI1P32566 snR77snR77 88 nt-1.23□□□□□ -2.61
SMI1P32566 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.23□□□□□ -2.61
SMI1P32566 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.25□□□□□ -2.61
SMI1P32566 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.26□□□□□ -2.61
SMI1P32566 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.27□□□□□ -2.61
SMI1P32566 YNL198CYNL198C 303 nt-1.28□□□□□ -2.61
SMI1P32566 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.3□□□□□ -2.62
SMI1P32566 snR81snR81 201 nt-1.31□□□□□ -2.62
SMI1P32566 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.31□□□□□ -2.62
SMI1P32566 YJL150WYJL150W 303 nt-1.33□□□□□ -2.62
SMI1P32566 Q0142Q0142 177 nt-1.35□□□□□ -2.63
SMI1P32566 YBL053WYBL053W 375 nt-1.4□□□□□ -2.63
SMI1P32566 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.45□□□□□ -2.64
SMI1P32566 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.46□□□□□ -2.64
SMI1P32566 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.46□□□□□ -2.64
SMI1P32566 YNR077CYNR077C 255 nt-1.48□□□□□ -2.65
SMI1P32566 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.51□□□□□ -2.65
SMI1P32566 YOR309CYOR309C 381 nt-1.52□□□□□ -2.65
SMI1P32566 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.54□□□□□ -2.66
SMI1P32566 SPG3YDR504C 384 nt-1.59□□□□□ -2.66
SMI1P32566 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.63□□□□□ -2.67
SMI1P32566 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.68□□□□□ -2.68
SMI1P32566 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.69□□□□□ -2.68
SMI1P32566 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.71□□□□□ -2.68
SMI1P32566 YGR151CYGR151C 336 nt-1.79□□□□□ -2.7
SMI1P32566 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.81□□□□□ -2.7
SMI1P32566 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.81□□□□□ -2.7
SMI1P32566 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.83□□□□□ -2.7
SMI1P32566 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.84□□□□□ -2.7
SMI1P32566 RPL41AYDL184C 78 nt-1.85□□□□□ -2.71
SMI1P32566 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.86□□□□□ -2.71
SMI1P32566 snR6snR6 112 nt-1.87□□□□□ -2.71
SMI1P32566 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.87□□□□□ -2.71
SMI1P32566 snR38snR38 95 nt-1.93□□□□□ -2.72
SMI1P32566 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.94□□□□□ -2.72
SMI1P32566 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.94□□□□□ -2.72
SMI1P32566 snR73snR73 106 nt-1.97□□□□□ -2.72
SMI1P32566 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.97□□□□□ -2.72
SMI1P32566 YNL338WYNL338W 159 nt-1.97□□□□□ -2.72
SMI1P32566 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.08□□□□□ -2.74
SMI1P32566 snR47snR47 99 nt-2.08□□□□□ -2.74
SMI1P32566 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.13□□□□□ -2.75
SMI1P32566 YNL337WYNL337W 255 nt-2.16□□□□□ -2.76
SMI1P32566 YDR543CYDR543C 300 nt-2.23□□□□□ -2.77
SMI1P32566 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.24□□□□□ -2.77
SMI1P32566 Q0032Q0032 291 nt-2.26□□□□□ -2.77
SMI1P32566 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.29□□□□□ -2.78
SMI1P32566 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.29□□□□□ -2.78
SMI1P32566 snR85snR85 171 nt-2.33□□□□□ -2.78
SMI1P32566 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.34□□□□□ -2.78
SMI1P32566 YKL225WYKL225W 348 nt-2.34□□□□□ -2.78
SMI1P32566 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.35□□□□□ -2.79
SMI1P32566 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.46□□□□□ -2.8
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