Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms