Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A5P29400 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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