Protein–RNA interactions for Protein: P28817

EHD3, 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EHD3P28817 snR69snR69 101 nt-0.65□□□□□ -2.51
EHD3P28817 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.65□□□□□ -2.51
EHD3P28817 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
EHD3P28817 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
EHD3P28817 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
EHD3P28817 YOR170WYOR170W 306 nt-0.67□□□□□ -2.52
EHD3P28817 snR39BsnR39B 96 nt-0.69□□□□□ -2.52
EHD3P28817 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.69□□□□□ -2.52
EHD3P28817 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.71□□□□□ -2.52
EHD3P28817 snR65snR65 100 nt-0.73□□□□□ -2.53
EHD3P28817 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.73□□□□□ -2.53
EHD3P28817 snR33snR33 183 nt-0.73□□□□□ -2.53
EHD3P28817 snR56snR56 88 nt-0.74□□□□□ -2.53
EHD3P28817 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.74□□□□□ -2.53
EHD3P28817 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.74□□□□□ -2.53
EHD3P28817 RDS3YPR094W 324 nt-0.74□□□□□ -2.53
EHD3P28817 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.75□□□□□ -2.53
EHD3P28817 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.75□□□□□ -2.53
EHD3P28817 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.75□□□□□ -2.53
EHD3P28817 snR50snR50 90 nt-0.75□□□□□ -2.53
EHD3P28817 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.76□□□□□ -2.53
EHD3P28817 YNL266WYNL266W 420 nt-0.77□□□□□ -2.53
EHD3P28817 YOR302WYOR302W 78 nt-0.78□□□□□ -2.53
EHD3P28817 snR161snR161 161 nt-0.79□□□□□ -2.54
EHD3P28817 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.85□□□□□ -2.55
EHD3P28817 JLP2YMR132C 627 nt-0.85□□□□□ -2.55
EHD3P28817 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.87□□□□□ -2.55
EHD3P28817 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.88□□□□□ -2.55
EHD3P28817 snR52snR52 92 nt-0.88□□□□□ -2.55
EHD3P28817 YBR178WYBR178W 375 nt-0.9□□□□□ -2.55
EHD3P28817 snR67snR67 82 nt-0.91□□□□□ -2.56
EHD3P28817 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.91□□□□□ -2.56
EHD3P28817 snR48snR48 113 nt-0.91□□□□□ -2.56
EHD3P28817 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.92□□□□□ -2.56
EHD3P28817 YNL205CYNL205C 423 nt-0.92□□□□□ -2.56
EHD3P28817 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.92□□□□□ -2.56
EHD3P28817 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.93□□□□□ -2.56
EHD3P28817 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.96□□□□□ -2.56
EHD3P28817 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.96□□□□□ -2.56
EHD3P28817 snR80snR80 171 nt-0.97□□□□□ -2.56
EHD3P28817 YOR102WYOR102W 351 nt-0.98□□□□□ -2.57
EHD3P28817 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.01□□□□□ -2.57
EHD3P28817 SKI7YOR076C 2244 nt-1.02□□□□□ -2.57
EHD3P28817 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
EHD3P28817 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.04□□□□□ -2.58
EHD3P28817 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.1□□□□□ -2.59
EHD3P28817 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.11□□□□□ -2.59
EHD3P28817 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.13□□□□□ -2.59
EHD3P28817 YNR077CYNR077C 255 nt-1.18□□□□□ -2.6
EHD3P28817 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.19□□□□□ -2.6
EHD3P28817 YNL198CYNL198C 303 nt-1.19□□□□□ -2.6
EHD3P28817 YBL053WYBL053W 375 nt-1.28□□□□□ -2.61
EHD3P28817 YJL150WYJL150W 303 nt-1.29□□□□□ -2.62
EHD3P28817 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.3□□□□□ -2.62
EHD3P28817 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.32□□□□□ -2.62
EHD3P28817 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.36□□□□□ -2.63
EHD3P28817 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.37□□□□□ -2.63
EHD3P28817 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.37□□□□□ -2.63
EHD3P28817 snR77snR77 88 nt-1.4□□□□□ -2.63
EHD3P28817 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.4□□□□□ -2.63
EHD3P28817 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.41□□□□□ -2.64
EHD3P28817 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.43□□□□□ -2.64
EHD3P28817 Q0142Q0142 177 nt-1.47□□□□□ -2.64
EHD3P28817 SPG3YDR504C 384 nt-1.49□□□□□ -2.65
EHD3P28817 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.51□□□□□ -2.65
EHD3P28817 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.53□□□□□ -2.65
EHD3P28817 snR81snR81 201 nt-1.55□□□□□ -2.66
EHD3P28817 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.57□□□□□ -2.66
EHD3P28817 YGR151CYGR151C 336 nt-1.58□□□□□ -2.66
EHD3P28817 RPL41AYDL184C 78 nt-1.59□□□□□ -2.66
EHD3P28817 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.6□□□□□ -2.67
EHD3P28817 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.61□□□□□ -2.67
EHD3P28817 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.61□□□□□ -2.67
EHD3P28817 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.64□□□□□ -2.67
EHD3P28817 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.67□□□□□ -2.68
EHD3P28817 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.68□□□□□ -2.68
EHD3P28817 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.69□□□□□ -2.68
EHD3P28817 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.72□□□□□ -2.68
EHD3P28817 snR38snR38 95 nt-1.73□□□□□ -2.69
EHD3P28817 YNL338WYNL338W 159 nt-1.76□□□□□ -2.69
EHD3P28817 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.78□□□□□ -2.69
EHD3P28817 snR47snR47 99 nt-1.78□□□□□ -2.69
EHD3P28817 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.81□□□□□ -2.7
EHD3P28817 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.83□□□□□ -2.7
EHD3P28817 YOR309CYOR309C 381 nt-1.86□□□□□ -2.71
EHD3P28817 YNL337WYNL337W 255 nt-1.92□□□□□ -2.72
EHD3P28817 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.02□□□□□ -2.73
EHD3P28817 YKL225WYKL225W 348 nt-2.04□□□□□ -2.74
EHD3P28817 snR6snR6 112 nt-2.06□□□□□ -2.74
EHD3P28817 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.13□□□□□ -2.75
EHD3P28817 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.15□□□□□ -2.75
EHD3P28817 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.15□□□□□ -2.75
EHD3P28817 Q0032Q0032 291 nt-2.16□□□□□ -2.76
EHD3P28817 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.16□□□□□ -2.76
EHD3P28817 snR73snR73 106 nt-2.21□□□□□ -2.76
EHD3P28817 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.21□□□□□ -2.76
EHD3P28817 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.22□□□□□ -2.76
EHD3P28817 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.24□□□□□ -2.77
EHD3P28817 snR61snR61 90 nt-2.25□□□□□ -2.77
EHD3P28817 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.25□□□□□ -2.77
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