Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms