Protein–RNA interactions for Protein: P24276

SSD1, Protein SSD1, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSD1P24276 snR61snR61 90 nt0.79□□□□□ -2.28
SSD1P24276 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.78□□□□□ -2.28
SSD1P24276 CSE1YGL238W 2883 nt0.78□□□□□ -2.28
SSD1P24276 PAU12YGR294W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
SSD1P24276 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 RPS26AYGL189C 360 nt0.77□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 SEC10YLR166C 2616 nt0.75□□□□□ -2.29
SSD1P24276 EST1YLR233C 2100 nt0.73□□□□□ -2.29
SSD1P24276 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.73□□□□□ -2.29
SSD1P24276 ORC3YLL004W 1851 nt0.73□□□□□ -2.29
SSD1P24276 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.73□□□□□ -2.29
SSD1P24276 YMR160WYMR160W 2451 nt0.73□□□□□ -2.29
SSD1P24276 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.72□□□□□ -2.29
SSD1P24276 MLP2YIL149C 5040 nt0.72□□□□□ -2.29
SSD1P24276 YMR326CYMR326C 309 nt0.7□□□□□ -2.3
SSD1P24276 snR69snR69 101 nt0.69□□□□□ -2.3
SSD1P24276 snR81snR81 201 nt0.68□□□□□ -2.3
SSD1P24276 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.67□□□□□ -2.3
SSD1P24276 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.65□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YHR217CYHR217C 462 nt0.65□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.65□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
SSD1P24276 UTP10YJL109C 5310 nt0.64□□□□□ -2.31
SSD1P24276 SBH1YER087C-B 249 nt0.63□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.61□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.61□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.6□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.6□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YOL014WYOL014W 375 nt0.6□□□□□ -2.31
SSD1P24276 FMP27YLR454W 7887 nt0.59□□□□□ -2.31
SSD1P24276 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.59□□□□□ -2.31
SSD1P24276 RDS3YPR094W 324 nt0.58□□□□□ -2.32
SSD1P24276 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.56□□□□□ -2.32
SSD1P24276 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.56□□□□□ -2.32
SSD1P24276 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.53□□□□□ -2.32
SSD1P24276 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.53□□□□□ -2.32
SSD1P24276 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.52□□□□□ -2.33
SSD1P24276 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.5□□□□□ -2.33
SSD1P24276 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.47□□□□□ -2.33
SSD1P24276 THO2YNL139C 4794 nt0.46□□□□□ -2.34
SSD1P24276 AI1Q0050 2505 nt0.45□□□□□ -2.34
SSD1P24276 ESP1YGR098C 4893 nt0.44□□□□□ -2.34
SSD1P24276 snR50snR50 90 nt0.44□□□□□ -2.34
SSD1P24276 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.43□□□□□ -2.34
SSD1P24276 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.37□□□□□ -2.35
SSD1P24276 snR62snR62 100 nt0.36□□□□□ -2.35
SSD1P24276 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.36□□□□□ -2.35
SSD1P24276 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.36□□□□□ -2.35
SSD1P24276 SOV1YMR066W 2697 nt0.36□□□□□ -2.35
SSD1P24276 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.35□□□□□ -2.35
SSD1P24276 snR47snR47 99 nt0.35□□□□□ -2.35
SSD1P24276 snR45snR45 172 nt0.33□□□□□ -2.36
SSD1P24276 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.31□□□□□ -2.36
SSD1P24276 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.31□□□□□ -2.36
SSD1P24276 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.29□□□□□ -2.36
SSD1P24276 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.28□□□□□ -2.36
SSD1P24276 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.26□□□□□ -2.37
SSD1P24276 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.25□□□□□ -2.37
SSD1P24276 snR67snR67 82 nt0.21□□□□□ -2.38
SSD1P24276 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.21□□□□□ -2.38
SSD1P24276 snR38snR38 95 nt0.19□□□□□ -2.38
SSD1P24276 RPL41AYDL184C 78 nt0.17□□□□□ -2.38
SSD1P24276 snR128snR128 126 nt0.17□□□□□ -2.38
SSD1P24276 YJL113WYJL113W 4647 nt0.14□□□□□ -2.39
SSD1P24276 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.14□□□□□ -2.39
SSD1P24276 SKI7YOR076C 2244 nt0.1□□□□□ -2.39
SSD1P24276 YKL225WYKL225W 348 nt0.09□□□□□ -2.4
SSD1P24276 snR64snR64 101 nt-0.02□□□□□ -2.41
SSD1P24276 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.05□□□□□ -2.42
SSD1P24276 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.13□□□□□ -2.43
SSD1P24276 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.14□□□□□ -2.43
SSD1P24276 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.17□□□□□ -2.44
SSD1P24276 snR53snR53 91 nt-0.18□□□□□ -2.44
SSD1P24276 URB1YKL014C 5295 nt-0.18□□□□□ -2.44
SSD1P24276 SBH2YER019C-A 267 nt-0.19□□□□□ -2.44
SSD1P24276 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.19□□□□□ -2.44
SSD1P24276 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.29□□□□□ -2.46 RIP-Chip
SSD1P24276 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.35□□□□□ -2.47
SSD1P24276 snR161snR161 161 nt-0.38□□□□□ -2.47
SSD1P24276 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.4□□□□□ -2.47
SSD1P24276 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
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