Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B4P23634 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms