Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPREP23469 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPREP23469 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPREP23469 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPREP23469 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms