Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNNI3P19429 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms