Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD8P13378 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD8P13378 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms