Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms