Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL11A1P12107 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms