Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PF4V1P10720 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PF4V1P10720 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms