Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRFP10586 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms