Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC192P0DO97 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms