Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL3A1P02461 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL3A1P02461 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms