Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSP01100 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSP01100 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSP01100 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOSP01100 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOSP01100 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms