Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIN3BO75182 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIN3BO75182 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms