Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM4AO75164 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM4AO75164 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms