Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRD4O60885 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRD4O60885 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms