Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SORBS3O60504 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORBS3O60504 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms